想要系统学习LAMMPS分子动力学模拟技术与应用?看这套视频
收到部分客户关于系统学习分子动力学模拟的需求,经与科技顾问余老师沟通确定,材料人APP举办了一个LAMMPS分子动力学模拟技术与应用线上培训班。目前,培训班的所有视频均已剪辑上线于APP
课程内容
整套内容分为三个独立的系列课,每个系列课分为上下两节。
系列课一(上)
**LAMMPS 基础精解**
结合Lammps in文件中各命令掌握
1. 分子动力学基础理论
- 1.1 分子动力学基本原理:分子运动论
- 1.2 各种势函数详解:做模拟时如何选择适合自己的势函数
- 1.3 分子动力学关键技术:分子动力学的主要算法介绍,时间积分方法
- 1.4 分子模拟条件和环境的控制:系综的选择
- 1.5 分子模拟加速方法:周期性边界条件,并行计算,GPU加速
- 1.6 分子动力学模拟流程详解:建模 > 能量最小化 > 模拟 > 结果分析
系列课一(下)
**Linux高性能计算入门 + Lammps软件定制化安装**
2. Linux高性能计算入门
- 2.1 Linux(CentOS)系统安装(物理机或虚拟机)
- 2.2 WinSCP, XShell远程软件安装配置详解
- 2.3 熟练掌握科学计算常用Linux命令
- 2.4 学习Linux软件编译安装方法,认识makefile文件
- 2.5 掌握在Linux服务器上安装并行计算软件openmpi,数学计算库fftw等
- 2.6 掌握在Linux服务器上安装Torque Pbs任务管理排队软件,科学管理计算任务
3. Lammps软件定制化安装
- 3.1 Lammps软件安装基本方法介绍
- 3.2 Lammps软件安装扩展包介绍-根据自己计算体系进行定制化安装
- 3.3 并行版Lammps,GPU加速版Lammps编译安装方法
实例操作:编译得到自己的并行版Lammps计算程序
系列课二(上)
**LAMMPS 模拟参数详解**
- 4.1 Lammps计算所需输入/输出文件构建和常用命令详解(in文件,data文件,lammpstrj 文件结构及格式)
- 4.2 Lammps计算流程控制(如何自由地高度自定义计算流程及施加各种外界条件)
- 4.3 Lammps力场势函数详解和参数说明(如何针对特定计算体系分析,准确选择力场)
- 4.4 Lammps的Windows版+Linux串行/并行版编译安装定制Lammps格式Notepad++编辑器(高亮Lammps文件关键词,让Lammps文件更清晰易读)
系列课二(下)
**LAMMPS 模拟入门实践**
- 5.1 结构弛豫
- 5.2 可视化快照
- 5.3 体系能量数据计算(原子受力;体系总能、动能、势能、温度;特定局部原子group能量、温度等)
- 5.4 均方差位移(msd)计算
- 5.5 径向分布(rdf)计算
- 5.6 扩散系数计算
- 5.7 热导率计算
实例操作:学员结合自己的研究课题,选择契合的例子进行模拟
系列课三(上)
**LAMMPS 进阶建模**
- 6.1 使用软件以及Lammps自有命令构建各种体系进阶模拟模型(混合溶液模型,固液混合模型,界面模型等)
- 6.2 各种格式结构文件转化为Lammps要求data文件格式方法
- 6.3 如何寻找力场参数,并导入自己的Lammps in文件
实例操作:学员结合自己的研究课题设计自己的模拟模型,并完成建模
系列课三(下)
**Lammps 进阶模拟流程设计及后处理/数据分析方法
7.1 如何设计合理的模拟计算流程,并写成Lammps in文件
7.2 如何选择需要计算和导出的相关体系性质
7.3 导出实时模拟结构图片和动态轨迹
7.4 用Materials Studio,VMD,VESTA等结构显示软件做出漂亮的结构图片和视频
7.5 体系动力学特性分析(均方差位移(MSD),结合Origin软件计算扩散系数等)
7.6 体系结构特征数据分析(结合VMD软件,进行原子密度分布分析(Density profile),计算径向分布函数(RDF),学会使用VMD中Tcl语言批量处理分析数据)
结合例程:"二维材料界面离子扩散/离子过滤研究"
培训价格
类别 | 价格 |
系列一 | 499元 |
系列二 | 599元 |
系列三 | 599元 |
全套 | 1499元 |
培训讲师
余老师,国内985高校博士毕业,现访学于法国著名材料研究组。余老师曾担任面向本科生的分子动力学课程讲师,以及本科生小组课外科研实践辅导教师,自2017年起担任材料人材料计算科技顾问,并担任分子动力学1对1培训讲师。
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