16个小时的零基础分子动力学入门讲授视频

1月5日6日，材料人举办了二维材料分子动力学线下培训，并录制了视频。现在，视频已经剪辑完毕在材料人APP上上线。

培训课表

第一节 分子动力学基础理论
1.1 分子动力学基本原理(分子运动论、势函数模型)
1.2 分子动力学关键技术（力场选择、时间积分处理、模拟条件控制、数值技巧）
1.3 分子动力学研究流程（软件选择、建模、能量最小化、模拟、结果分析

第二节 分子动力学软件建模基础
2.1 导入模型、基本操作、导出模型
2.2 由晶体参数构建原胞
2.3 构建超胞、引入缺陷
2.4 建立表面、设置真空层
2.5 草画分子
2.6 二维材料表面添加指定分子
2.7 构建石墨烯、MXene等典型二维材料模型
2.8 构建石墨烯等二维纳米带模型

第三节 Windows平台分子动力学模拟实践
3.1 Windows平台分子动力学计算流程详解
3.2 构建各种体系模拟模型(混合模型、界面模型等)
3.3 模拟实践：石墨烯二维纳米孔水分子透过离子过滤模拟

第四节 Linux高性能计算入门+软件安装
4.1 Linux（CentOS）系统安装（物理机或虚拟机）
4.2 WinSCP, XShell远程软件安装配置详解
4.3 Lammps的Windows版+Linux串行/并行版编译安装定制Lammps格式Notepad++编辑器（高亮Lammps文件关键词，让Lammps文件更清晰易读）

第五节 Lammps操作基础+命令详解
5.1 Lammps计算所需输入/输出文件构建和命令详解（in文件，data文件，lammpstrj 文件结构及格式）
5.2 Lammps计算流程控制（如何自由地高度自定义计算流程及施加各种外界条件）
5.3 Lammps力场势函数详解和参数说明（如何针对特定计算体系分析，准确选择力场）

第六节 Lammps模拟结果后处理/数据分析方法
6.1 体系能量数据分析（原子受力；体系总能、动能、势能、温度；特定局部原子group能量、温度等）
6.2 体系动力学特性分析（均方差位移（MSD），结合Origin软件计算扩散系数等）
结合例程“二维材料界面离子扩散/离子过滤研究”
6.3 体系结构特征数据分析（结合VMD软件，进行原子密度分布分析（Density profile），计算径向分布函数（RDF），学会使用VMD中Tcl语言批量处理分析数据）
6.4 电极/电解质界面双电层结构，电场分布，电势分布分析（结合Matlab软件，学习使用Matlab软件强大的数据处理和计算功能，学会用Matlab脚本后处理/分析数据）
6.5 电极/电解质界面双电层比电容计算方法
结合例程“二维材料界面双电层结构及比电容特性研究”
6.6 二维材料晶格热导率计算
结合例程“二维材料热导率计算原理与模拟设计”
6.7 二维材料表面摩擦特性研究
结合例程“二维材料表面摩擦性质计算原理与模拟设计”

培训讲师

余老师，国内985高校博士毕业，现访学于法国著名材料研究组。余老师曾担任面向本科生的分子动力学课程讲师，以及本科生小组课外科研实践辅导教师，自2017年起担任材料人材料计算科技顾问，并担任分子动力学1对1培训讲师。

自2018年5月起，担任材料人分子动力学线上训练营讲师至今，已辅导超过200位学员。